一、樣品方面
1.除去微粒及雜質
2.了解樣品在流動相中的溶解度
如溶樣品的溶劑不是流動相，一定要用流動相試溶解度，防止其在流動相中析出
3.了解樣品與色譜柱的基質/填料是否有相互作用
二、流動相方面
1.除去微粒
純度的要求：超純水，梯度實驗時水中有機雜質含量要低；緩沖液的PH值，在填料的允許范圍內；緩沖液（鹽）的濃度；有機溶劑：色譜純，雜質含量盡量低，并與填料相匹配
2.流動相對樣品的溶解度
有機溶劑或水的比例
三、色譜柱的清洗
對所做的樣品要有充分的了解，用對該樣品洗脫能力zui強的流動相清洗
硅膠柱的一般方法是先用甲醇洗去極性雜質，然后用干燥的二氯甲烷、正庚烷100~200ml依次活化
鍵合相柱（烷基）的一般方法是用20倍體積的甲醇-氯仿-甲醇-水依次沖洗
（記住：每種色譜柱可能性有特定的方法，一定要先看其使用說明！）
四、色譜柱的存放
存放前的處理要除去雜質、緩沖鹽
合適的存放溶劑
避免色譜柱床的干涸
避免機械震動
防止細菌生長
注意存放的溫度